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北京市农林科学院玉米中心在鲜食糯玉米遗传多样性和系统发育方面取得重要研究进展

放大字体  缩小字体 发布日期:2020-11-26    来源:北京市农林科学院    浏览次数:273    评论:0
导读

近日,北京市农林科学院玉米中心在国际学术期刊Scientific Reports(JCR 分区Q1)上发表题为“Sequence polymorphism of the waxy gene in waxy maize accessions forbid characterization of a new waxy allele”的研究论文,对200份糯玉米种质的遗传多样性、亲缘关系进行了分析,构建了玉米远源种、普通玉米、糯玉米农家种和糯玉米自交系间的系统发育树,并鉴定到新的waxy基因突变类型。

  近日,北京市农林科学院玉米中心在国际学术期刊Scientific Reports(JCR 分区Q1)上发表题为“Sequence polymorphism of the waxy gene in waxy maize accessions forbid characterization of a new waxy allele”的研究论文,对200份糯玉米种质的遗传多样性、亲缘关系进行了分析,构建了玉米远源种、普通玉米、糯玉米农家种和糯玉米自交系间的系统发育树,并鉴定到新的waxy基因突变类型。

  糯玉米是普通玉米传入中国后突变产生,具有特殊的营养、加工和经济价值。中国糯玉米种质资源丰富,但是糯玉米的进化历史过程以及糯玉米种质间的亲缘关系尚不清楚。决定玉米糯质特性的waxy基因存在多种突变类型,发掘新的waxy基因突变体并开发其分子标记,可为针对性地鉴定、筛选和选育糯玉米种质提供有效方法。基于此,玉米中心从北京市(包括优良糯玉米品种京科糯2000的父母本)、陕西省、吉林省和韩国收集糯玉米种质200份,利用自主研发并列入农业行业标准(NY/T 1432-2014)的40对核心SSR引物进行基因分型,发现200份糯玉米种质的多态性信息含量(PIC)平均值为0.7,遗传变异丰富,并可划分为3大类群。该结果为糯玉米种质的利用及品种选育提供参考。
  图1   200份糯玉米种质类群划分

  对其中167份糯玉米和另外14份普通玉米进行waxy基因全长测序,在SKN5等8份糯玉米材料中鉴定到一个新的waxy基因突变类型,它在waxy基因的第3个外显子处存在2286 bp的转座子插入突变,根据转座子类型将该突变类型命名为wx-hAT突变,针对该突变序列开发了PCR功能分子标记。该发现及所开发的分子标记对于保护和利用SKN5等珍稀糯玉米种质具有重要意义。

  图2   新的waxy基因突变类型wx-hAT的序列特征

  序列变异分析发现糯玉米waxy基因核苷酸多态性低于普通玉米,并且显著偏离中性突变范围,表明受到了明显的选择效应,为糯玉米waxy基因位点受到人工选择提供了分子证据。基于大刍草等8份玉米远源种,7份糯玉米农家种,167份糯玉米自交系和14份普通玉米自交系的waxy基因序列构建系统发育树,也再次证实了大刍草是玉米的祖先,一些糯玉米是由普通玉米转育而来。167份糯玉米种质存在5种类型的waxy基因突变,wx-D7(第7外显子的30bp缺失突变)为主要突变类型,携带相同waxy突变的糯玉米种质聚集在同一分支,waxy突变类型不同的糯玉米种质分布在不同的分支,新发现的wx-hAT突变型糯玉米存在于独立的分支中。这些结果对糯玉米的起源进化提供参考。

  图3   基于waxy基因序列构建的系统发育树

  骆美洁博士、史亚兴研究员和杨扬博士为该论文第一作者,赵久然研究员、卢柏山研究员为共同通讯作者。该研究得到了北京市自然科学基金、北京学者计划、北京市科技计划项目、北京市农林科学院创新团队建设项目的资助。

  原文链接:

  https://www.nature.com/articles/s41598-020-72764-3

 
(文/小编)
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